当然了，黄来福在奏疏中对播州当地改土归的建议也让朝中争成一片，一声音是对黄来福为武人却妄议地方政务颇为不满，显然这是文官们的事。当然也有一分人赞成黄来福的意见，在播州实行改土归的好大家都看得见，可以大大增加朝廷的与税收。

黄来福的手段烈震慑住了附近的土司们，这些人其实与外的胡人一样，都是畏威而不怀德之辈，见到杨应龙及家族如此下场，心寒之下，也不敢再生什么异心，否则将来自己及族人就是这样的下场。黄来福的手段，让他们心下畏惧的同时也产生了另一个效果，就是历史上的奢安之没有再现，这对大明与奢崇明、安彦等人来说，都是好事。

一系列庆祝活动后，万历皇帝下令碎杨应龙尸，杨应龙儿杨朝栋、杨兆龙二人被凌迟于市，余者叛将百余人被斩，并宣告天下。杨氏自唐代播州八百余年，自此而绝。

十一月下，黄来福率两镇军队离开因大规模建设而显得喧腾一片的播州，回转自己的五寨堡。

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不过黄来福却是决心己定，很快，他的报捷奏疏快送京师，上面还有自己对于播州当地的理建议，希望在当地改土归，并将俘虏的十余万土兵及眷属送到外去苦力，一方面作为他们的惩罚，一方面也为当地减少不稳定因素，免得官兵走后，这些人又反了。同时间的，杨应龙尸，还有他的儿杨朝栋、杨兆龙等叛将百余人一起被装囚车，械送京师。此外还有一分的缴获一起送京城内。

不过对于黄来福来说，不论是为国为己，自己都不许可土司制在播州一带死灰复燃，改土归是为必然。他并不介意接下来播州之地会有什么反复，如当地土人再闹事，他不介意用长枪与火铳让他们明白什么叫安静与守秩序。有可能的话，他还会建议万历帝慢慢在西南与大明各地撤销所有的土司与羁勒州。

不算黄来福的平播债券费银支，此次播州之役前后费银二、三百万两，还有将士赏赐死伤都需要抚恤奖励，让国库又是一空，不过从播州及海龙囤中缴获的杨应龙积蓄足有数百万两之多，其中上朝廷的银两就达到二百多万两之多，大大补充了国库的需求，让万历皇帝大喜，这黄卿每次兵的军费都有着落，真是好啊。心喜之下，对于黄来福在播州一带为了他平播债券的所作所为，便是睁一只，闭一只了。

在等待京师回应的同时，黄来福也不闲着，在播州各地回来清理，俘虏中的土人军官目，杨应龙亲信，当地投靠杨应龙的土人豪族等，尽数杀了，并抄没了他们的土地财产，他们的族人也尽数抓重庆，等着送到外去开农场。杨氏家族经营播州数百年，在当地的势力盘错节，不过在黄来福的严厉打击下，杨氏在当地势力一扫而空，没有任何再死灰复燃的机会。

播州大捷传京师后，朝中腾，万历皇帝也是大喜，这黄卿果真是国之福将，才几个月时间，就平定了播州杨逆之，为自己去了一个心病。他喜之下，率领群臣去祭告郊庙，大臣们也是纷纷上表称贺。

，却被当时四川与贵州级官员屡屡放过，便是害怕事端，姑息养的结果。

对于黄来福的改土归意向，四川巡抚李化龙，贵州巡抚郭章，湖广巡抚支大可都有些异议，虽说播州之地能改土归，对于他们也是大功一件，不过他们却是担心别土司官们的反应，还不如保持现状为好。下播州刚定，可别又有什么事来，对下大明来说，多一事，不如少一事不是？

在黄来福清理下，播州的杨应龙及土人豪势力一扫而空，大批手持平播债券的商民涌播州，还有许多周边汉民也纷纷移民播州之地，到一片喧嚣的新气象。

最后还是万历皇帝拍板决定，十一月初，他旨意，在播州之地实行改土归，并将播州分为两府，一府叫平越府，划归贵州省。一府叫遵义府，继续隶属四川省。同时他还同意了黄来福将十余万被俘土兵及眷属押运外服役的法。

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完这些事后，就是**行赏。黄来福为平播总督，当然为功，可惜他年纪太轻，官位太，赏无可赏，只得传旨嘉奖，赏赐金钱财货若，不过对于其手下的报功，却是无一不准，杨小驴升为副将，顾大刀升为游击，跟随黄来福来播的两个夫一样升官，厚恩，让百官嫉妒。除此外，李化龙，郭章，支大可等人皆有封赏。总兵吴广、刘綎、麻锦等人也是一样的**行赏。

也有一分人表示担忧与反对，言西南各地几百年实行土司制度，虽有弊端，大还是好的，大战之后，还是实行怀柔政策比较好，免得周边的土司们兔死狐悲，起了异心，对于黄来福的将被俘土兵及土人遣送到外活更是大力抨击，言这是不行仁政。